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Enregistrement W1975547934 · doi:10.1111/j.1365-2672.2009.04231.x

Host range and lytic capability of four bacteriophages against bovine and clinical human isolates of Shiga toxin-producing<i>Escherichia coli</i>O157:H7

2009· article· en· W1975547934 sur OpenAlexaffabout
Yan D. Niu, Roger P. Johnson, Yongping Xu, Tim A. McAllister, Ritika Sharma, Marie Louie, Kim Stanford

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensProvincial Laboratory of Public HealthUniversity of LethbridgePublic Health Agency of CanadaAgriculture and Agri-Food CanadaAgriculture Food and Rural Development
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLytic cycleMicrobiologyEscherichia coliShiga toxinToxinBiologyBacteriophageVirologyBacteriaHost (biology)EnterobacteriaceaeShiga-like toxinMicrobial toxinsVirusGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: To evaluate host range and lytic capability of four bacteriophages (rV5, wV7, wV8 and wV11) against Escherichia coli O157:H7 (STEC O157:H7) from cattle and humans. METHODS AND RESULTS: Four hundred and twenty-two STEC O157:H7 isolates (297 bovine; 125 human) were obtained in Alberta, Canada. The four phages were serially diluted and incubated for 5 h with overnight cultures of STEC O157:H7 to estimate their multiplicity of infection (MOI). All bovine STEC O157:H7 were subjected to pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and phage typing (PT). Phage wV7 lysed all human and bovine isolates irrespective of PFGE genotype or PT phenotype and exhibited the lowest MOI (0.004-0.006, P < 0.0001) of all phages. Phages rV5 and wV11 exhibited a lower MOI (0.002-0.04, P < 0.0001) than did phage wV8 (25-29) and they had a narrower host range than wV7 or wV8. Phages rV5, wV11 and wV8 lysed 342 (81.0%), 321 (76.1%) and 407 (96.4%), respectively, of the 422 isolates. Susceptibility of bovine STEC O157:H7 to rV5, w11 and wV8 was influenced by PFGE genotype and/or PT phenotype. CONCLUSIONS: Phages exhibited activity against the majority of bovine and human STEC O157:H7 isolates. PFGE genotype and/or PT phenotype of the host-target influenced their vulnerability to phage attack. Susceptibility of bovine STEC O157:H7 to phage may also differ among farms. Both lytic capability and host range should be considered in the selection of therapeutic phage for on-farm control of STEC O157:H7. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: The present work indicates that a four-phage cocktail should be equally effective at mitigating STEC O157:H7 isolates both of bovine and of human origin. Given that some STEC O157:H7 exhibited resistance to some but not all phages, a phage cocktail is the logical approach to efficacious on-farm therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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