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Enregistrement W1975553299 · doi:10.1139/g08-098

Insect mitochondrial genomics 3: the complete mitochondrial genome sequences of representatives from two neuropteroid orders: a dobsonfly (order Megaloptera) and a giant lacewing and an owlfly (order Neuroptera)

2009· article· en· W1975553299 sur OpenAlexafffundvenue
Andrew T. Beckenbach, James B. Stewart

Notice bibliographique

RevueGenome · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFossil Insects in Amber
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Calgary
Mots-clésNeuropteraBiologyMitochondrial DNAGeneticsGenomeGene duplicationEvolutionary biologyGeneBotanyLarva

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We describe the complete mitochondrial genomes from representatives of two orders of the Neuropterida: a dobsonfly, Corydalus cornutus (Megaloptera: Corydalidae, GenBank Accession No. FJ171323), a giant lacewing Polystoechotes punctatus (Neuroptera: Polystoechotidae, FJ171325), and an owlfly, Ascaloptynx appendiculatus (Neuroptera: Ascalaphidae, FJ171324). The dobsonfly sequence is 15,687 base pairs with a major noncoding (A+T rich) region of approximately 967 bp. The gene content and organization of the dobsonfly is identical to that of most insects. The giant lacewing sequence is 16 036 bp with a major noncoding region of about 1123 bp, while the owlfly sequence is 15,877 bp with a major noncoding region of about 1066 bp. The two Neuroptera sequences include a transposition of two tRNA genes, tRNATrp and tRNACys. These tRNA genes are coded on opposite strands and overlap by seven residues in the standard insect mitochondrial gene arrangement. Thus, the transposition required a duplication of at least the region of overlap. It is likely that the transposition occurred by a duplication of both genes followed by deletion of one copy of each gene. Examination of this region in two other neuropteroid species, a snakefly, Agulla sp. (Raphidioptera: Raphidiidae), and an antlion, Myrmeleon immaculatus (Neuroptera: Myrmeleontidae), shows that the rearrangement is widespread in the order Neuroptera but not present in either of the other two orders of Neuropterida.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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