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Enregistrement W1975565537 · doi:10.1128/jb.182.5.1251-1256.2000

Regulation of Cold Shock-Induced RNA Helicase Gene Expression in the Cyanobacterium <i>Anabaena</i> sp. Strain PCC 7120

2000· article· en· W1975565537 sur OpenAlexafffund
Danuta Chamot, George W. Owttrim

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCold-shock domainBiologyTranscription (linguistics)Messenger RNAGene expressionRNAProtein biosynthesisAnabaenaMolecular biologyTranslation (biology)GeneCell biologyBiochemistryCyanobacteriaGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Expression of the Anabaena sp. strain PCC 7120 RNA helicase gene crhC is induced by cold shock. crhC transcripts are not detectable at 30 degrees C but accumulate at 20 degrees C, and levels remain elevated for the duration of the cold stress. Light-derived metabolic capability, and not light per se, is required for crhC transcript accumulation. Enhanced crhC mRNA stability contributes significantly to the accumulation of crhC transcripts, with the crhC half-life increasing sixfold at 20 degrees C. The accumulation is reversible, with the cells responding more rapidly to temperature downshifts than to upshifts, as a result of the lack of active mRNA destabilization and the continuation of crhC transcription, at least transiently, after a temperature upshift. Translational inhibitors do not induce crhC expression to cold shock levels, indicating that inhibition of translation is only one of the signals required to activate the cold shock response in Anabaena. Limited amounts of protein synthesis are required for the cold shock-induced accumulation of crhC transcripts, as normal levels of accumulation occur in the presence of tetracycline but are abolished by chloramphenicol. Regulation of crhC expression may also extend to the translational level, as CrhC protein levels do not correlate completely with the pattern of mRNA transcript accumulation. Our experiments indicate that the regulation of crhC transcript accumulation is tightly controlled by both temperature and metabolic activity at the levels of transcription, mRNA stabilization, and translation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,404

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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