Dispersal of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> via the Canadian fur trade
Notice bibliographique
Résumé
Patterns of gene flow can have marked effects on the evolution of populations. To better understand the migration dynamics of Mycobacterium tuberculosis, we studied genetic data from European M. tuberculosis lineages currently circulating in Aboriginal and French Canadian communities. A single M. tuberculosis lineage, characterized by the DS6(Quebec) genomic deletion, is at highest frequency among Aboriginal populations in Ontario, Saskatchewan, and Alberta; this bacterial lineage is also dominant among tuberculosis (TB) cases in French Canadians resident in Quebec. Substantial contact between these human populations is limited to a specific historical era (1710-1870), during which individuals from these populations met to barter furs. Statistical analyses of extant M. tuberculosis minisatellite data are consistent with Quebec as a source population for M. tuberculosis gene flow into Aboriginal populations during the fur trade era. Historical and genetic analyses suggest that tiny M. tuberculosis populations persisted for ∼100 y among indigenous populations and subsequently expanded in the late 19th century after environmental changes favoring the pathogen. Our study suggests that spread of TB can occur by two asynchronous processes: (i) dispersal of M. tuberculosis by minimal numbers of human migrants, during which small pathogen populations are sustained by ongoing migration and slow disease dynamics, and (ii) expansion of the M. tuberculosis population facilitated by shifts in host ecology. If generalizable, these migration dynamics can help explain the low DNA sequence diversity observed among isolates of M. tuberculosis and the difficulties in global elimination of tuberculosis, as small, widely dispersed pathogen populations are difficult both to detect and to eradicate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».