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Enregistrement W1975623546 · doi:10.4081/mm.2010.2462

Development of an EliSPOT assay for detection of CMV-specific immune response

2010· article· en· W1975623546 sur OpenAlexaboutno aff
Maria Elena Terlizzi, Sara Astegiano, Francesca Sidoti, Stefano Gambarino, Rossana Cavallo, Cristina Costa, Massimiliano Bergallo

Notice bibliographique

RevueMicrobiologia medica · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésELISPOTImmune systemAntigenImmunologyAntibodyBiologyVirologyT cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The Cytomegalovirus (CMV) is the major cause of morbidity and mortality in solid organ (SOT) and bone marrow (BMT) transplantation. An early reconstitution of immune response is crucial in limiting CMV replication; on the other hand, a late reconstitution may determine CMV reactivation with possible evolution to symptomatic phase.The Enzyme-Linked Immunosorbent Spot (EliSPOT) assay is a useful tool for monitoring the CMV-specific immune response recovery in transplant patients.This study propose the development and optimization of a interferon-gamma-(IFN-γ)-based EliSPOT assay for the detection of CMV immune response. Methods: CD3 + lymphocytes were separated using Robosep (negative selection, HLA ® EasySep WB Human T Cell Enrichment Kit, Stemcell Technology,Vancouver, Canada).The EliSPOT assay was optimized using the Human IFN gamma ELISPOT Kit and a modified protocol provided by Nanogen Advanced Diagnostics (Buttigliera Alta, Italy). Different parameters were analyzed: number of cells (200,000 - 300,000), antigens (CMV peptide mix and whole CMV antigen), incubation time (18 - 20 - 22 - 24h), number of washes, incubation conditions with secondary antibody and conditions of substrate development. Results: Herein we report the optimal conditions identified. 200,000 CD3+ cells per well were stimulated with CMV peptide mix antigens. Cells were stimulated for 18h at 37 °C in humidified atmosphere; wells were washed and secondary antibody was added and incubated at room temperature for 2h.After incubation a second series of washes were performed. Substrate was added and incubation for 15 minutes was carried out.The reaction was detected by plate reader AID ELISPOT (Strassberg, Germany). Conclusions:We developed an EliSPOT assay for the detection of CMV-immune response and reconstitution.All variables were compared to previous published protocols.The improvement of the EliSPOT assay for the detection of CMV-specific immune response represents the first step for result evaluation in clinical practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,204
Score d'incertitude au seuil0,414

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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