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Enregistrement W1975899243 · doi:10.1097/01.ogx.0000279314.45442.bb

A Common Allele on Chromosome 9 Associated With Coronary Heart Disease

2007· article· en· W1975899243 sur OpenAlexaff
Ruth McPherson, Alexander Pertsemlidis, Nihan Kavaslar, Alexandre F.R. Stewart, Robert Roberts, David R. Cox, David A. Hinds, L Pennacchio, Anne Tybjærg‐Hansen, Aaron R. Folsom, Eric Boerwinklle, Helen H. Hobbs, Jonathan C. Cohen

Notice bibliographique

RevueObstetrical & Gynecological Survey · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInternal medicineDiabetes mellitusAllelePopulationCoronary artery diseaseSingle-nucleotide polymorphismCDKN2AType 2 diabetesCardiologyGeneticsEndocrinologyGeneGenotypeBiologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Coronary heart disease (CHD), the commonest cause of death worldwide, is highly heritable, but the DNA sequence variations associated with elevated cardiovascular risk are largely unknown. The investigators planned a genome-wide associational study based on 100,000 single nucleotide polymorphisms and involving 3 sequential case-control comparisons made at a nominal significance threshold of P < 0.025. The study population included more than 23,000 participants from 4 Caucasian populations. Cases had severe, premature CHD starting before age 60 years and leading to coronary artery revascularization. Controls were healthy Caucasian men over age 65 and women over age 70 who lacked symptoms and a history of CHD. Individuals with diabetes or hypercholesterolemia were excluded. A 58-kilobase interval on chromosome 9p21 was consistently associated with CHD. The interval is near the CDKN2A and CDKN2B genes. It contains no annotated genes and is not associated with established CHD risk factors such as diabetes, plasma lipoproteins, or hypertension. Between 20% and 25% of Caucasians are homozygous for the risk allele, and they have an approximately 30%–40% increased risk of CHD. Mechanisms for the association between the risk allele and CHD remain incompletely understood. The allele might promote the development of atherosclerotic plaque, augment thrombogenesis, or increase the tendency of plaques to rupture. The association persisted after controlling for numerous possible confounding factors including age, gender, plasma lipid levels, blood pressure, diabetes, and plasma levels of C-reactive protein. The researchers believe that the effect of the risk allele on chromosome 9 on CHD is not mediated by established risk factors for cardiovascular disease. The present findings support the use of the whole-genome association approach for studying conditions as complex as CHD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations524
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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