MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1975960841 · doi:10.1074/jbc.m804177200

Activation of Cdk2 Stimulates Proteasome-dependent Truncation of Tyrosine Phosphatase SHP-1 in Human Proliferating Intestinal Epithelial Cells

2008· article· en· W1975960841 sur OpenAlexafffund
Mélanie Simoneau, Jim Boulanger, Geneviève Coulombe, Marc‐André Renaud, Cathia Duchesne, Nathalie Rivard

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésProtein tyrosine phosphataseCell biologyPhosphataseCancer researchTruncation (statistics)ChemistryTyrosineBiologyInternal medicinePhosphorylationMedicineBiochemistryMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SHP-1 is expressed in the nuclei of intestinal epithelial cells (IECs). Increased SHP-1 expression and phosphatase activity coincide with cell cycle arrest and differentiation in these cells. Suspecting the tumor-suppressive properties of SHP-1, a yeast two-hybrid screen of an IEC cDNA library was conducted using the full-length SHP-1 as bait. Characterization of many positive clones revealed sequences identical to a segment of the Cdk2 cDNA sequence. Interaction between SHP-1 and Cdk2 was confirmed by co-immunoprecipitations whereby co-precipitated Cdk2 phosphorylated SHP-1 protein. Inhibition of Cdk2 (roscovitine) or proteasome (MG132) was associated with an enhanced nuclear punctuate distribution of SHP-1. Double labeling localization studies with signature proteins of subnuclear domains revealed a co-localization between the splicing factor SC35 and SHP-1 in bright nucleoplasmic foci. Using Western blot analyses with the anti-SHP-1 antibody recognizing the C terminus, a lower molecular mass species of 45 kDa was observed in addition to the full-length 64-65-kDa SHP-1 protein. Treatment with MG132 led to an increase in expression of the full-length SHP-1 protein while concomitantly leading to a decrease in the levels of the lower mass 45-kDa molecular species. Further Western blots revealed that the 45-kDa protein corresponds to the C-terminal portion of SHP-1 generated from proteasome activity. Mutational analysis of Tyr(208) and Ser(591) (a Cdk2 phosphorylation site) residues on SHP-1 abolished the expression of the amino-truncated 45-kDa SHP-1 protein. In conclusion, our results indicate that Cdk2-associated complexes, by targeting SHP-1 for proteolysis, counteract the ability of SHP-1 to block cell cycle progression of IECs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,554

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetProtein Tyrosine PhosphatasesTravaux en français237 207