MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1976030423 · doi:10.1021/jp0441590

Orientation and Dynamics of Benzyl Alcohol and Benzyl Alkyl Ethers Dissolved in Nematic Lyotropic Liquid Crystals. <sup>2</sup>H NMR and Molecular Dynamics Simulations

2005· article· en· W1976030423 sur OpenAlexaff
Hernán Ahumada, Rodrigo Montecinos, D. Peter Tieleman, Boris Weiss‐López

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMolecular spectroscopy and chirality
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryLiquid crystalAlkylBilayerMolecular dynamicsRing (chemistry)Benzyl alcoholCrystallographyMoleculeRelaxation (psychology)LyotropicMolecular geometryComputational chemistryMembraneOrganic chemistryMaterials sciencePhase (matter)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most drugs have to cross cell membranes to reach their final target. A better understanding of the distribution, interactions, and dynamics of biologically active molecules in model bilayers is of fundamental importance in understanding drug functioning and design. 2H NMR quadrupole splittings (delta nu(Q)) and longitudinal relaxation times (T1) from the aromatic ring of benzyl alcohol-d5 (C0), a commonly used anesthetic, and a series of linear alkyl benzyl-d5 ethers with chain lengths from 1 to 12 carbon atoms (C1-C12), were measured. The molecules were dissolved in a nematic discotic lyotropic liquid crystal solution made of tetradecyltrimethylammonium chloride (TTAC)/decanol (DeOH)/NaCl/H2O. Values of delta nu(Q) and T1 from 1,1-dideuteriodecanol (15% enriched) and DHO (H2O with 0.2% D2O) were also measured. Delta nu(Q) of DeOH and DHO remained constant throughout the series. The value of delta nu(Q) of the para position of the ring (delta nu(p)) in C1 is 30% smaller than the delta nu(p) of C0. This is attributed to the existence of an H-bond between the alcohol hydroxyl proton and the solvent, which influences the average orientation of the ring. The relaxation data show that T1o,m is always longer than T1p and both decrease with the increase in alkyl chain length. Molecular dynamics simulations of the experimentally studied systems were performed. The aggregate was represented as a bilayer. The distribution, average orientation, and order parameters of the aromatic ring of the guest molecules in the bilayer were examined. Rotational correlation functions of all the C-D bonds and the OH bond from H2O were evaluated, allowing an estimate of the correlation times and T1. According to these results all spins relax in extreme narrowing conditions, except DeOH. Experimental and calculated T1 values differ at most by a factor of 3. However, the order of magnitude and the observed trends are well reproduced by the calculations. The aromatic ring of C0 possesses a unique average orientation in the bilayer. For the ether series, the orientation is modified and the C2 symmetry axis of the aromatic ring is exchanging between two orientations averaging the quadrupole splittings from the ortho and meta positions. The simulation supports the existence of an H-bond between C0 and the solvent not found in the ethers, which should be responsible for the observed differences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,614
Score d'incertitude au seuil0,633

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Physical Chemistry AMême sujetMolecular spectroscopy and chiralityTravaux en français237 207