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Enregistrement W1976212131 · doi:10.1089/bio.2013.0064

A Framework for Biobank Sustainability

2014· article· en· W1976212131 sur OpenAlexaff
Peter H. Watson, Sara Y. Nussbeck, Candace Carter, Sheila O’Donoghue, Stefanie Cheah, Lise Matzke, Rebecca Barnes, John M.S. Bartlett, Jane Carpenter, William E. Grizzle, Randal N. Johnston, Anne‐Marie Mes‐Masson, Leigh C. Murphy, Katherine C. Sexton, Lois Shepherd, Daniel Simeon‐Dubach, Nikolajs Zeps, Brent Schacter

Notice bibliographique

RevueBiopreservation and Biobanking · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensCancerCare ManitobaCentre Hospitalier de l’Université de MontréalUniversity of CalgaryQueen's UniversityCanadian Respiratory Research NetworkUniversity of British ColumbiaOntario Institute for Cancer ResearchBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésBiobankSustainabilityRelevance (law)BusinessEnvironmental resource managementEnvironmental planningKnowledge managementPolitical scienceComputer scienceGeographyBioinformaticsEconomicsEcologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Each year funding agencies and academic institutions spend millions of dollars and euros on biobanking. All funding providers assume that after initial investments biobanks should be able to operate sustainably. However the topic of sustainability is challenging for the discipline of biobanking for several major reasons: the diversity in the biobanking landscape, the different purposes of biobanks, the fact that biobanks are dissimilar to other research infrastructures and the absence of universally understood or applicable value metrics for funders and other stakeholders. In this article our aim is to delineate a framework to allow more effective discussion and action around approaches for improving biobank sustainability. The term sustainability is often used to mean fiscally self-sustaining, but this restricted definition is not sufficient for biobanking. Instead we propose that biobank sustainability should be considered within a framework of three dimensions - financial, operational, and social. In each dimension, areas of focus or elements are identified that may allow different types of biobanks to distinguish and evaluate the relevance, likelihood, and impact of each element, as well as the risks to the biobank of failure to address them. Examples of practical solutions, tools and strategies to address biobank sustainability are also discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,033
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,967
Score d'incertitude au seuil0,174

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0330,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0050,005
Études des sciences et des technologies0,0080,050
Communication savante0,0190,019
Science ouverte0,0030,011
Intégrité de la recherche0,0110,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,415
Tête enseignante GPT0,566
Écart entre enseignants0,151 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations132
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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