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Enregistrement W1976307040 · doi:10.1046/j.1529-8817.1999.00001-180.x

A CANDID ASSESSMENT OF SYSTEMATICS IN THE LAMINARIALES: MUDDLED MORPHOLOGIES AND SKETCHY SEQUENCES

2000· article· en· W1976307040 sur OpenAlexaff
Gary W. Saunders, Christopher E. Lane, Charlene Mayes

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySystematicsKelpPhylogenetic treeEvolutionary biologyInternal transcribed spacerMolecular phylogeneticsRibosomal DNAPhylogeneticsMolecular clockAlgaePaleontologyEcologyTaxonomy (biology)Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Algae of the Alariaceae, Laminariaceae and Lessoniaceae are the largest, most complex, and, arguably, most fascinating of the seaweeds. It is, therefore, a profound paradox that these species remain in taxonomic chaos despite the contemporary emphases on systematics. Setchell and Gardner established the classification system in 1925, recognizing these families on the basis of clear morphological features. At that time, however, they acknowledged that some species had features consistent with placement in two families, or that obscured logical placement in any of the families. Ironically, the problems noted by Setchell and Gardner have been ignored and the system has become entrenched in kelp literature. Initial molecular studies highlighted the shortcomings noted by Setchell and Gardner, and further indicated that little of the morphology‐based system was natural. It was obvious that the diagnostic morphological features, presence or absence of sporophylls and ontogenetic splitting, were ‘noisy’ being gained and lost independently many times in kelp evolution. Despite the insights of the initial molecular studies, they had limitations and key relationships remained unresolved. The investigations used the Internal Transcribed Spacers (ITS) of the ribosomal cistron that have phylogenetic limitations owing to their short length, which is exacerbated by the many variable regions that can't be aligned confidently and must be removed prior to phylogenetic analyses. Many molecular publications have appeared subsequent to the first ITS results, and their contribution towards elucidating kelp phylogeny will be assessed. Current investigations using the Large Subunit ribosomal DNA (LSU) for kelp systematics will also be discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0020,005
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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