Non-Michaelis-Menten kinetics model for conductance of low-conductance potassium ion channels
Notice bibliographique
Résumé
A reduced kinetics model is proposed for ion permeation in low-conductance potassium ion channels with zero net electrical charge in the selectivity filter region. The selectivity filter is assumed to be the only conductance-determining part of the channel. Ion entry and exit rate constants depend on the occupancy of the filter due to ion-ion interactions. The corresponding rates are assumed slow relative to the rates of ion motion between binding sites inside the filter, allowing a reduction of the kinetics model of the filter by averaging the entry and exit rate constants over the states with a particular occupancy number. The reduced kinetics model for low-conductance channels is described by only three states and two sets of effective rate constants characterizing transitions between these states. An explicit expression for the channel conductance as a function of symmetrical external ion concentration is derived under the assumption that the average electrical mobility of ions in the selectivity filter region in a limited range of ion concentrations does not depend on these concentrations. The simplified conductance model is shown to provide a good description of the experimentally observed conductance-concentration curve for the low-conductance potassium channel Kir2.1, and also predicts the mean occupancy of the selectivity filter of this channel. We find that at physiological external ion concentrations this occupancy is much lower than the value of two ions observed for one of the high-conductance potassium channels, KcsA.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,006 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».