Membrane integration and topology of the first transmembrane segment in normal and Southeast Asian ovalocytosis human erythrocyte anion exchanger 1
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Notice bibliographique
Résumé
Anion exchanger 1 (AE1, or Band 3) is an integral membrane glycoprotein found in erythrocytes, responsible for the electroneutral exchange of chloride and bicarbonate ions across the plasma membrane. Southeast Asian ovalocytosis (SAO) results from a nine-amino acid deletion in the first transmembrane segment (TM) of the AE1 protein that abolishes its transport function. The effects of the SAO deletion on: (1) the efficiency of integration of TM1 into the membrane, and (2) the precise positioning of TM1 relative to the membrane were investigated using scanning N-glycosylation mutagenesis in a cell-free transcription/translation system and in transfected HEK293 cells. AE1 or SAO constructs containing either the endogenous N-glycosylation site at Asn642 in extracellular loop 4 (EC4) or single N-glycosylation sites engineered into an expanded extracellular loop 1 (EC1) were used. N-glycosylation efficiency of EC1 in the SAO construct was significantly lower than that of the AE1 construct, indicating that the SAO deletion impairs membrane integration of TM1 and the translocation of EC1 across the membrane. Scanning N-glycosylation mapping of EC1 in the cell-free system and in transfected cells showed that the C-terminus of both AE1 and SAO TM1 were at the same position relative to the membrane. Thus, the SAO deletion is likely to cause a pulling-in of the polar amino acid sequence immediately N-terminal to the deletion into the lipid bilayer, allowing SAO TM1 that was inserted to assume a transmembrane disposition.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle