NMR Structure and Dynamics of a Receptor-active Apolipoprotein E Peptide
Notice bibliographique
Résumé
Apolipoprotein E (apoE) is important in lipid metabolism due to its interaction with members of the low density lipoprotein (LDL) receptor family. ApoE is able to interact with the LDL receptor only when it is bound to lipid particles. To address structural aspects of this phenomenon, a receptor-active apoE peptide, encompassing the receptor-binding region of the protein, was studied by NMR in the presence of the lipid-mimicking agent trifluoroethanol. In 50% trifluoroethanol, apoE-(126-183) forms a continuous amphipathic alpha-helix over residues Thr(130)-Glu(179). Detailed NMR relaxation analysis indicates a high degree of plasticity for the residues surrounding 149-159. This intrinsic flexibility imposes a curvature to the peptide that may be important in terms of interaction of apoE with various sized lipid particles and the LDL receptor. Residues 165-179 of apoE may act as a molecular switch whereby these residues are unstructured in the absence of lipids and prevent interaction with the LDL receptor. In the presence of lipids, these residues become helical resulting in a receptor-active conformation of the protein. Furthermore, the electrostatic characteristics and geometric features of apoE-(126-183) suggest that apoE binds to the LDL receptor by interacting with more than one of the receptor ligand-binding repeats.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».