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Enregistrement W1976604740 · doi:10.1016/j.str.2008.05.006

Structural Basis for the Recognition of Histone H4 by the Histone-Chaperone RbAp46

2008· article· en· W1976604740 sur OpenAlexafffund
Natalia V. Murzina, Xue-Yuan Pei, Wei Zhang, Mike Sparkes, Jose Vicente-Garcia, J. Venkatesh Pratap, Stephen H. McLaughlin, Tom Rolef Ben-Shahar, Alain Verreault, Ben F. Luisi, Ernest D. Laue

Notice bibliographique

RevueStructure · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchInstitute of Materials Research and EngineeringWellcome Trust
Mots-clésHistone octamerHistone H4NucleosomeChaperone (clinical)HistoneHistone H1ChemistryHistone codeBiologyCell biologyBiochemistryDNAMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RbAp46 and RbAp48 (pRB-associated proteins p46 and p48, also known as RBBP7 and RBBP4, respectively) are highly homologous histone chaperones that play key roles in establishing and maintaining chromatin structure. We report here the crystal structure of human RbAp46 bound to histone H4. RbAp46 folds into a seven-bladed beta propeller structure and binds histone H4 in a groove formed between an N-terminal alpha helix and an extended loop inserted into blade six. Surprisingly, histone H4 adopts a different conformation when interacting with RbAp46 than it does in either the nucleosome or in the complex with ASF1, another histone chaperone. Our structural and biochemical results suggest that when a histone H3/H4 dimer (or tetramer) binds to RbAp46 or RbAp48, helix 1 of histone H4 unfolds to interact with the histone chaperone. We discuss the implications of our findings for the assembly and function of RbAp46 and RbAp48 complexes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations210
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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