Expression, Purification, and Structural Characterization of CfrA, a Putative Iron Transporter from <i>Campylobacter jejuni</i>
Notice bibliographique
Résumé
The gene for the Campylobacter ferric receptor (CfrA), a putative iron-siderophore transporter in the enteric food-borne pathogen Campylobacter jejuni, was cloned, and the membrane protein was expressed in Escherichia coli, affinity purified, and then reconstituted into model lipid membranes. Fourier transform infrared spectra recorded from the membrane-reconstituted CfrA are similar to spectra that have been recorded from other iron-siderophore transporters and are highly characteristic of a beta-sheet protein (approximately 44% beta-sheet and approximately 10% alpha-helix). CfrA undergoes relatively extensive peptide hydrogen-deuterium exchange upon exposure to (2)H(2)O and yet is resistant to thermal denaturation at temperatures up to 95 degrees C. The secondary structure, relatively high aqueous solvent exposure, and high thermal stability are all consistent with a transmembrane beta-barrel structure containing a plug domain. Sequence alignments indicate that CfrA contains many of the structural motifs conserved in other iron-siderophore transporters, including the Ton box, PGV, IRG, RP, and LIDG motifs of the plug domain. Surprisingly, a homology model reveals that regions of CfrA that are expected to play a role in enterobactin binding exhibit sequences that differ substantially from the sequences of the corresponding regions that play an essential role in binding/transport by the E. coli enterobactin transporter, FepA. The sequence variations suggest that there are differences in the mechanisms used by CfrA and FepA to interact with bacterial siderophores. It may be possible to exploit these structural differences to develop CfrA-specific therapeutics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».