Electrophoresis‐assisted open‐tubular liquid chromatography/mass spectrometry for the analysis of lipooligosaccharide expressed by <b><i>Campylobacter jejuni</i></b>
Notice bibliographique
Résumé
Lipooligosaccharide (LOS) is the major component of the external membrane of Campylobacter jejuni. LOS contains a hydrophobic moiety, lipid A, and a hydrophilic moiety, oligosaccharide. Due to the unique mimicry of human ganglioside structures and potential involvement in the induction of the autoimmune polyneuropathies, Guillain-Barré and Miller Fisher syndromes, the structural characterization of C. jejuni LOS has received much attention. We have been using capillary zone electrophoresis-mass spectrometry to analyze O-deacylated LOS from C. jejuni. In an attempt to optimize the separation conditions, the effect of methanol on the separation of LOS was investigated. It was found that methanol resulted in stronger adsorption of LOS onto the wall of fused-silica capillary. In this paper, we applied this adsorption to perform electrophoresis-assisted open-tubular liquid chromatography electrospray mass spectrometry for the analysis of O-deacylated LOS mixtures from C. jejuni. The analytical potential of the proposed strategy for the analysis of O-deacylated LOS glycoforms from five bacterial colonies is demonstrated. Online tandem mass spectrometry is shown to provide a powerful tool for characterization of variations in the hexosamine backbone, phosphorylation of the lipid A, and sialic acid sequence information.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».