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Enregistrement W1976684063 · doi:10.1158/1538-7445.am10-2240

Abstract 2240: Clinical significance of <i>CEA, PRL3</i> and <i>EZH2</i> transcripts expressed in lymph nodes of colorectal cancer patients

2010· article· en· W1976684063 sur OpenAlexaff
Alain E. Lagarde, C B Wood, Maha Guindi, Hartley Stern

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensJewish General HospitalToronto General HospitalOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineColorectal cancerLymphLymph nodeStage (stratigraphy)OncologyInternal medicineT-stageGastroenterologyCancerOverall survivalPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective: The role of micrometastases detected immunologically and molecularly in lymph nodes of colorectal cancer patients remains elusive. We investigated the prognostic significance of CEA, PRL3 and EZH2 expressed in lymph nodes of 42 pathologically node-negative (pN0) colorectal patients and 13 stage III/IV patients as controls. Seventeen pN0 patients (40%) received adjuvant therapy after curative surgery. Experimental design: CEA, PRL3 and EZH2 transcripts were amplified by reverse transcription PCR in nearly 600 paraffin embedded lymph nodes. On average 9.7 ± 5.7 nodes were harvested per case. After 55 months median follow-up, gene expression was correlated with recurrence-free (RFS), overall (OS) and disease-free survival (DFS), using Kaplan-Meier analysis and log-rank test for comparison. Results: The proportion of cases demonstrating CEA+, PRL3+ and EZH2+lymph node expression increased from stage I to III/IV and reached 71%, 76% and 26% respectively in the pN0 group. EZH2 had no significant prognostic value among pN0 patients. Disease progressed more rapidly (50% DFS at 30 versus 53 months) in EZH2+ than EZH2- node-positive patients. CEA+ was associated with ∼18% lower RFS/OS, and 8% lower DFS than CEA- among therapeutically-untreated patients, those with colon and with stage II tumors. pN0 patients with PRL3+ nodes had better outcomes than PRL3- cases (DFS, P= 0.059), namely in the colorectal (OS, P= 0.056; DFS, P= 0.12), colon (DFS, P= 0.056) and stage II tumor in the non-adjuvant settings (DFS, P= 0.0047). Conclusions: Lymph node expression of the PRL3 phosphatase gene predicted more favorable outcomes for pN0 colorectal cancer patients. The role of CEA as an adverse predictor of survival was confirmed albeit less significant than previously reported. Neither CEA nor PRL3 nodal expression was predictive of rectal cancer recurrence. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 2240.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,382
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
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