Specific Sites in the Cytoplasmic N Terminus Modulate Conformational Transitions of the Na,K-ATPase
Notice bibliographique
Résumé
The cytoplasmic N terminus of the Na,K-ATPase is a highly charged and flexible structure that comprises three predicted helical regions including H1 spanning residues 27 to 33 and H2 spanning residues 42 to 50. Previous deletion mutagenesis experiments showed that deletion of residues up to and including most of H2 shifts the E(1)/E(2) conformational equilibrium toward E(1). The present study describes a clustered charge-to-alanine mutagenesis approach designed to delineate specific sites within the N terminus that modulate the steady-state E(1) <--> E(2) and E(1)P <--> E(2)P poise. Criteria to assess shifts in poise include (i) sensitivity to inhibition by inorganic orthovanadate to assess overall poise; (ii) K(+)-sensitivity of Na-ATPase measured at micromolar ATP to assess changes in the E(2)(K) + ATP --> E(1) x ATP + K(+) rate; (iii) K'(ATP) for low-affinity ATP binding at the latter step; (iv) overall catalytic turnover, and (v) the E(1)P --> E(2)P transition. The results of alanine replacements in H1 (31KKE) suggest that this site stabilizes E(2)P and to a lesser extent E(2). In H2, residues within 47HRK have a role in stabilizing E(2) but not E(2)P as revealed with double mutants 31KKE --> AAA/47H --> A and 31KKE --> AAA/47HRK --> AAA. Taken together, these observations suggest that sites 31KKE in H1 and 47HRK in H2 have distinct roles in modulating the enzyme's conformational transitions during the catalytic cycle of the enzyme.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».