A new DIG‐PCR‐EIA method for the detection of <i>Chlamydia pneumoniae</i> DNA in clinical samples
Notice bibliographique
Résumé
Chlamydia pneumoniae, a common respiratory pathogen, may also play a role in the pathogenesis of other chronic conditions. For accurate detection of infected persons and verification of results obtained by other PCR methods, a DIG-PCR-EIA method was evaluated. In the DIG-PCR-EIA, a 437 bp DNA sequence was amplified and hybridized with a newly synthesized 229 bp biotin-labeled probe. The end product was detected by an enzyme immunoassay. The sensitivity of DIG-PCR-EIA was compared with Southern blot hybridization and one-step HR/HL PCR, which was the routine method used. DNA was detected to the level of 20 elementary bodies of DIG-EIA-PCR compared to less than 2 by Southern blot, and 200 by HR/HL PCR. Thus a 100-fold increase in sensitivity could be expected by DIG-EIA-PCR compared to the routine method. Throat swabs and adenoid tissue from 22 children with otitis and middle ear secretions from 29 children, as well as throat swabs from 179 blood donors, were analyzed with DIG-EIA-PCR, HL/HR PCR and nested touchdown PCR. 32% of the ear secretions were positive by DIG-EIA-PCR as compared to 5% by the other two methods. Three adenoid tissue samples were positive by all methods applied. Among the child and adult throat samples, 18% and 32%, respectively, were positive by DIG-EIA-PCR and 5% and 10% by HR/HLPCR. The results indicate the suitability of DIG-PCR-EIA for verification of results of HR/HL PCR. DIG-PCR-EIA has a potential for increased sensitivity and adaptation for automation. It should be further evaluated using various types of tissue specimens and DNA extraction methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».