MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1976864423 · doi:10.1111/jnc.12970

Localization of heat shock protein <scp>HSPA</scp>6 (<scp>HSP</scp>70B') to sites of transcription in cultured differentiated human neuronal cells following thermal stress

2014· article· en· W1976864423 sur OpenAlexafffund
Sam Khalouei, Ari M. Chow, Ian R. Brown

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyNucleolusHeat shock proteinCell biologySplicing factorHsp70RNA splicingRNATranscription factorHeat shockRNA-binding proteinMolecular biologyGeneGeneticsNucleus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heat shock proteins (Hsps) are a set of highly conserved proteins that are involved in cellular repair and protective mechanisms. In order to identify potential stress-sensitive sites in differentiated SH-SY5Y human neuronal cells, localization of two inducible members of the HSPA (HSP70) family was investigated, namely HSPA6 (HSP70B') and HSPA1A (HSP70-1). Following heat shock, yellow fluorescent protein (YFP)-tagged HSPA6 and HSPA1A proteins localized to nuclear speckles that are enriched in RNA splicing factors (identified by SC35 and SON marker proteins) and then to the granular component of the nucleolus (identified by nucleophosmin). Subsequently, YFP-HSPA6 protein, but not YFP-HSPA1A, localized to the periphery of nuclear speckles that are sites of RNA transcription. The HSPA6 gene is present in the human genome but not in genomes of rat and mouse. Hence, current animal models of neurodegenerative diseases are lacking a potentially protective member of the HSPA family. Potential stress-sensitive sites were identified in differentiated human SH-SY5Y cells by the localization of HSPA6 (HSP70B') and HSPA1A (HSP70-1) to nuclear components following heat shock. HSPA6 and HSPA1A rapidly moved to nuclear speckles, enriched in RNA splicing factors, then to the granular layer of the nucleolus. Subsequently, HSPA6 exhibited a novel localization not observed for the more widely studied HSPA1A, namely association with the periphery of nuclear speckles that are sites of transcription. HS = heat shock; HSPA6 = HSP70B' protein; HSPA1A = HSP70-1 protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of NeurochemistryMême sujetHeat shock proteins researchTravaux en français237 207