IC‐01‐02: Effect of APOE‐e4 load and GOLPH2 genotype on regional grey matter volumes in subjects with Alzheimer's disease
Notice bibliographique
Résumé
APOEe4 (APOE4) is the best established genetic risk factor for sporadic Alzheimer's disease (AD), and GOLPH2, a Golgi transmembrane protein, has been shown to be a potential susceptibility gene for AD in a recent whole genome scan. In order to better define specific influences of these genes on neurodegeneration, we use a Voxel-Based-Morphometry (VBM) analysis to test for the effects of these genes on grey matter volume (GMV). To determine the genotypic effects of the number of APOEe4 alleles and GOLPH2 (RS10868366) status on regional GMV in AD patients. 100 patients with AD, according to the NINCDS-ADRDA criteria, were recruited for imaging from a larger association genetic study cohort. Satisfactory imaging was available for 83 subjects with APOE genotyping data, and 72 subjects with GOLPH2. In the first analysis, the additive effect of the number of APOE4 alleles was estimated and tested, while in the second the effect of having the GG 'risk' genotype of GOLPH2 (RS10868366) was estimated and tested. In both models, nuisance variables of age, age of onset of AD, gender, image acquisition site, number of years of education and a masking covariate indicating if a manual masking was used to aid the segmentation, were included. An APOE4 additive model showed GMV reduction with increasing APOE4 load in medial temporal lobe structures bilaterally including the amygdala, the hippocampus, the parahippocampal gyrus and the temporal fusiform cortex, as well as in the orbitofrontal cortex, and is shown below in red. Over the significant region, mean GMV was reduced by 13.83±2.53% (mean±SE) in homozygotes compared to non-carriers. The GOLPH2 genotypic model showed GMV reduction in the risk 'GG' genotype in the left frontal pole shown below, with a reduction in GMV of 14.7±2.7% over the significant region. Our analysis identifies a reduction in grey matter volume associated with the number of APOE4 alleles in AD subjects, and to our knowledge is the first formal testing of an additive model for APOE4 effects on localised brain atrophy. We also provide evidence for a regional reduction in grey matter volume associated with GOLPH2 (RS10868366) in AD subjects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».