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Enregistrement W1976901632 · doi:10.1194/jlr.m700167-jlr200

Evolutionary conservation of drug action on lipoprotein metabolism-related targets

2007· article· en· W1976901632 sur OpenAlexaff
Abdelmadjid K. Hihi, Marie‐Claude Beauchamp, Robyn Branicky, Annick Desjardins, I. Casanova, Marie-Pierre Guimond, Melissa Carroll, Mélanie Éthier, Irenej Kianicka, Kevin M. McBride, Siegfried Hekimi

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensMcGill UniversityChevron (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApolipoprotein BLipid metabolismLipoproteinCaenorhabditis elegansMutantBiologyBiochemistryDrug discoveryMetabolismMicrosomal triglyceride transfer proteinCholesterolChemistryVery low-density lipoproteinGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic analysis has shown that the slower than normal rhythmic defecation behavior of the clk-1 mutants of Caenorhabditis elegans is the result of altered lipoprotein metabolism. We show here that this phenotype can be suppressed by drugs that affect lipoprotein metabolism, including drugs that affect HMG-CoA reductase activity, reverse cholesterol transport, or HDL levels. These pharmacological effects are highly specific, as these drugs affect defecation only in clk-1 mutants and not in the wild-type and do not affect other behaviors of the mutants. Furthermore, drugs that affect processes not directly related to lipid metabolism show no or minimal activity. Based on these findings, we carried out a compound screen that identified 190 novel molecules that are active on clk-1 mutants, 15 of which also specifically decrease the secretion of apolipoprotein B (apoB) from HepG2 hepatoma cells. The other 175 compounds are potentially active on lipid-related processes that cannot be targeted in cell culture. One compound, CHGN005, was tested and found to be active at reducing apoB secretion in intestinal Caco-2 cells as well as in HepG2 cells. This compound was also tested in a mouse model of dyslipidemia and found to decrease plasma cholesterol and triglyceride levels. Thus, target processes for pharmacological intervention on lipoprotein synthesis, transport, and metabolism are conserved between nematodes and vertebrates, which allows the use of C. elegans for drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,362

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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