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Enregistrement W1976936263 · doi:10.1002/jor.21161

Early‐onset metaphyseal chondrodysplasia type Schmid associated with a <i>COL10A1</i> frame‐shift mutation and impaired trimerization of wild‐type α1(X) protein chains

2010· article· en· W1976936263 sur OpenAlexafffund
Outi Mäkitie, Miki Susic, William G. Cole

Notice bibliographique

RevueJournal of Orthopaedic Research® · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAcademy of Finland
Mots-clésHaploinsufficiencyMutantWild typeNonsense mutationMutant proteinMutationBiologyProbandNonsenseMissense mutationMolecular biologyChemistryGeneticsPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Both dominant-negative and haploinsufficiency effects have been proposed in the pathogenesis of metaphyseal chondrodysplasia type Schmid (MCDS) due to nonsense and frame-shift mutations of COL10A1. This study examines these alternative effects. A proband with typical early-onset MCDS was ascertained and COL10A1 sequencing undertaken. The assembly of trimeric collagen X molecules was studied using in vitro coupled transcription and translation of wild-type and mutant α1(X) cDNAs. The proband was heterozygous for a unique COL10A1 mutation, c.1735_1739del5ins22. Mutant protein chains, with the corresponding p.G579fsX611 change, failed to spontaneously trimerize. When wild-type α1(X) chains were translated alone, 57 ± 7% of the chains assembled into stable collagen X trimers. Trimerization of wild-type chains was significantly reduced to 33 ± 6% when translated in 1:1 mixtures with p.G579fsX611 α1(X) chains. The protein assembly assay showed that the mutant chains exerted a dominant-negative effect on collagen X assembly. Previous studies indicate that nonsense-mediated decay, activation of endoplasmic reticulum, and unfolded protein responses as well as altered chondrocyte differentiation are the major determinants of phenotypic severity and age of presentation. We speculate that complete loss of mutant transcripts yields COL10A1 haploinsufficiency and late clinical presentation while incomplete loss of mutant transcripts yields dominant-negative effects with early clinical presentation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,789
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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