Molecular evidence for an active endogenous microbiome beneath glacial ice
Notice bibliographique
Résumé
Geologic, chemical and isotopic evidence indicate that Earth has experienced numerous intervals of widespread glaciation throughout its history, with roughly 11% of present day Earth's land surface covered in ice. Despite the pervasive nature of glacial ice both today and in Earth's past and the potential contribution of these systems to global biogeochemical cycles, the composition and phylogenetic structure of an active microbial community in subglacial systems has yet to be described. Here, using RNA-based approaches, we demonstrate the presence of active and endogenous archaeal, bacterial and eukaryal assemblages in cold (0-1 °C) subglacial sediments sampled from Robertson Glacier, Alberta, Canada. Patterns in the phylogenetic structure and composition of subglacial sediment small subunit (SSU) ribosomal RNA (rRNA) assemblages indicate greater diversity and evenness than in glacial surface environments, possibly due to facilitative or competitive interactions among populations in the subglacial environment. The combination of phylogenetically more even and more diverse assemblages in the subglacial environment suggests minimal niche overlap and optimization to capture a wider spectrum of the limited nutrients and chemical energy made available from weathering of bedrock minerals. The prevalence of SSU rRNA affiliated with lithoautotrophic bacteria, autotrophic methane producing archaea and heterotrophic eukarya in the subglacial environment is consistent with this hypothesis and suggests an active contribution to the global carbon cycle. Collectively, our findings demonstrate that subglacial environments harbor endogenous active ecosystems that have the potential to impact global biogeochemical cycles over extended periods of time.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».