Rarity of the Alzheimer Disease–Protective<i>APP</i>A673T Variant in the United States
Notice bibliographique
Résumé
IMPORTANCE: Recently, a rare variant in the amyloid precursor protein gene (APP) was described in a population from Iceland. This variant, in which alanine is replaced by threonine at position 673 (A673T), appears to protect against late-onset Alzheimer disease (AD). We evaluated the frequency of this variant in AD cases and cognitively normal controls to determine whether this variant will significantly contribute to risk assessment in individuals in the United States. OBJECTIVE: To determine the frequency of the APP A673T variant in a large group of elderly cognitively normal controls and AD cases from the United States and in 2 case-control cohorts from Sweden. DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Case-control association analysis of variant APP A673T in US and Swedish white individuals comparing AD cases with cognitively intact elderly controls. Participants were ascertained at multiple university-associated medical centers and clinics across the United States and Sweden by study-specific sampling methods. They were from case-control studies, community-based prospective cohort studies, and studies that ascertained multiplex families from multiple sources. MAIN OUTCOMES AND MEASURES: Genotypes for the APP A673T variant were determined using the Infinium HumanExome V1 Beadchip (Illumina, Inc) and by TaqMan genotyping (Life Technologies). RESULTS: The A673T variant genotypes were evaluated in 8943 US AD cases, 10 480 US cognitively normal controls, 862 Swedish AD cases, and 707 Swedish cognitively normal controls. We identified 3 US individuals heterozygous for A673T, including 1 AD case (age at onset, 89 years) and 2 controls (age at last examination, 82 and 77 years). The remaining US samples were homozygous for the alanine (A673) allele. In the Swedish samples, 3 controls were heterozygous for A673T and all AD cases were homozygous for the A673 allele. We also genotyped a US family previously reported to harbor the A673T variant and found a mother-daughter pair, both cognitively normal at ages 72 and 84 years, respectively, who were both heterozygous for A673T; however, all individuals with AD in the family were homozygous for A673. CONCLUSIONS AND RELEVANCE: The A673T variant is extremely rare in US cohorts and does not play a substantial role in risk for AD in this population. This variant may be primarily restricted to Icelandic and Scandinavian populations.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».