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Enregistrement W1977198497 · doi:10.1128/jb.187.2.687-696.2005

Biochemical Activities of the <i>absA</i> Two-Component System of <i>Streptomyces coelicolor</i>

2005· article· en· W1977198497 sur OpenAlexafffund
Nancy L. Sheeler, Susan V. MacMillan, Justin R. Nodwell

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensHealth Sciences CentreMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésStreptomyces coelicolorBiologyResponse regulatorPhosphataseTwo-component regulatory systemGeneAntibioticsKinasePsychological repressionMutantGeneticsBiochemistryPhosphorylationGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The AbsA1 sensor kinase and its cognate response regulator AbsA2 are important regulators of antibiotic synthesis in Streptomyces coelicolor. While certain point mutations in absA1 reduce or eliminate the synthesis of several antibiotics, null mutations in these genes bring about enhanced antibiotic synthesis. We show here that AbsA1, which is unusual in sequence and structure, is both an AbsA2 kinase and an AbsA2 approximately P phosphatase. The half-life of AbsA2 approximately P in solution is 68.6 min, consistent with a role in maintaining a relatively stable state of transcriptional repression or activation. We find that mutations in the absA locus that enhance antibiotic synthesis impair AbsA2 kinase activity and that mutations that repress antibiotic synthesis impair AbsA2 approximately P phosphatase activity. These results support a model in which the phosphorylation state of AbsA2 is determined by the balance of the kinase and phosphatase activities of AbsA1 and where AbsA2 approximately P represses antibiotic biosynthetic genes either directly or indirectly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,240

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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