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Enregistrement W1977233361 · doi:10.1097/01.fpc.0000189799.88596.04

A single nucleotide polymorphism in CHAT influences response to acetylcholinesterase inhibitors in Alzheimer's disease

2006· article· en· W1977233361 sur OpenAlexfundno aff
Denise Harold, Stuart MacGregor, Cathryn E. Patterson, Paul Hollingworth, Pamela J. Moore, Michael J. Owen, Julie Williams, Michael O‘Donovan, Peter Passmore, Stephen P. McIlroy, Lesley Jones

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholinesterase and Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilAlzheimer Society
Mots-clésAcetylcholinesteraseCholine acetyltransferaseSingle-nucleotide polymorphismCholinergicAlzheimer's diseaseCholinesteraseDonepezilSNPAchéInternal medicineDiseaseNeurodegenerationPolymorphism (computer science)BiologyMedicinePharmacologyEndocrinologyPsychologyGeneticsAlleleGeneDementiaEnzymeBiochemistryGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Alzheimer's disease (AD) is a devastating neurodegeneration with a characteristic deficit in cholinergic neurotransmission. Treatment with acetylcholinesterase (AChE) inhibitors aims to reverse this deficit and does ameliorate the decline in cognition in some AD patients, although response is variable. OBJECTIVE: To examine whether sequence variation in the gene encoding choline acetyltransferase (CHAT), which encodes the major catalytic enzyme of the cholinergic pathway, predicts response to AChE inhibitors. METHODS: Alzheimer's disease patients (121) were treated with cholinesterase inhibitors and the effect of treatment on cognition was measured using the Mini Mental State Examination (MMSE). Six polymorphisms in CHAT were analysed for association with change in MMSE score. RESULTS: After correction for multiple testing, we found one SNP, rs733722, in a promoter region of CHAT, is associated with response of AD patients to cholinesterase inhibitors (P = 0.03) and accounts for 6% of the variance in response to AChE inhibitors. CONCLUSION: Rs733722 represents a putative marker of response to AChE inhibitors in AD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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