Spatio-temporal characterization of retinal opsin gene expression during thyroid hormone-induced and natural development of rainbow trout
Notice bibliographique
Résumé
The abundance and spatial distribution of retinal cone photoreceptors change during thyroid hormone (TH)-induced and natural development of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). These changes are thought to allow the fish to adapt to different photic environments throughout its life history. To date, the ontogeny of rainbow trout cone photoreceptors has been examined using physiological and morphological approaches. In this study, we extended these observations by measuring opsin gene expression in retinal quadrants during natural and TH-induced development. Gene expression during natural development was investigated in retinae from fish at both parr and smolt stages. The role of TH in modulating opsin gene expression was determined in TH-treated parr and control fish sampled after two, nine, and 22 days of treatment. Total RNA was isolated from each retinal quadrant and steady-state opsin mRNA levels were measured using reverse transcriptase real-time quantitative polymerase chain reaction (QPCR) analysis. Expression of ultraviolet-sensitive opsin (SWS1), rod opsin (RH1), middle wavelength-sensitive opsin (RH2), and long wavelength-sensitive opsin (LWS) transcripts vary spatially in the parr retina. Smolts, compared to parr, had downregulated SWS1 expression in all quadrants, lower LWS expression dorsally, higher RH1 expression nasally, and higher RH2 expression dorsally. In TH-treated parr, SWS1 opsin expression was downregulated in the nasal quadrants by two days. SWS1 displayed the greatest degree of downregulation in all quadrants after nine days of treatment, with an increase in short wavelength-sensitive (SWS2) and RH2 opsin mRNA expression in the temporal quadrants. This study reveals that opsin genes display spatially significant differences within rainbow trout retina in their level of mRNA expression, and that regulation of opsin expression is a dynamic process that is influenced by TH. This is particularly evident for SWS1 gene expression in parr following TH-induced and natural development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».