MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1977262904 · doi:10.1097/tp.0000000000000203

Determinants of C1q Binding in the Single Antigen Bead Assay

2014· article· en· W1977262904 sur OpenAlexaff
Stefan Schaub, Gideon Hönger, Michael Koller, Robert Liwski, Patrizia Amico

Notice bibliographique

RevueTransplantation · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBeadAntigenChemistryMolecular biologyImmunologyChromatographyMedicineBiologyMaterials scienceComposite material

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A modified single antigen bead (SAB) assay measuring C1q binding to human leukocyte antigen antibodies has recently been introduced. The aim of this study was to investigate the determinants of C1q binding on SAB. METHODS: Sera from 73 sensitized patients were analyzed by the generic IgGpan as well as IgG subclass specific SAB assays and correlated with the standard and an anti-human globulin (AHG) enhanced C1q test. RESULTS: Among 2,665 SABs with positive IgGpan results (mean fluorescence intensity [MFI]>500), strong complement-binding IgG1 and IgG3 subclasses accounted for a median of 99% (interquartile range, 76%-100%) of the total IgG amount. IgGpan MFI alone showed a very strong association with standard C1q positivity (r=0.72), which was superior to a model including all IgG subclass MFI (r=0.62). Combining all IgG subclass MFI and IgGpan MFI only marginally improved the prediction of standard C1q positivity compared with IgGpan MFI alone (Δr=0.02). IgGpan MFI greater than 14,154 predicted standard C1q positivity, with 92% sensitivity and 96% specificity. Notably, 1,840 (93%) of the 1,974 C1q-negative SABs contained human leukocyte antigen antibodies with strong complement-binding IgG1 and IgG3 subclasses. Anti-human globulin significantly enhanced the signal in the C1q assay, but the association of AHG C1q positivity with IgGpan MFI was less strong (r=0.51). CONCLUSION: C1q binding on SAB is strongly associated with IgGpan MFI. IgG subclass information only marginally improves prediction of C1q binding likely because complement-binding IgG1 and IgG3 subclasses dominate regarding frequency and relative amounts. A negative C1q assay result does not indicate the absence of strong complement-binding IgG subclasses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTransplantationMême sujetBlood groups and transfusionTravaux en français237 207