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Enregistrement W1977277903 · doi:10.1042/0264-6021:3570203

Role of the cystine-knot motif at the C-terminus of rat mucin protein Muc2 in dimer formation and secretion

2001· article· en· W1977277903 sur OpenAlexaff
Sherilyn L. Bell, Gongqiao Xu, J. Forstner

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCysteineCystineDimerChemistryBiochemistryAmino acidStereochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA constructs based on the 534-amino-acid C-terminus of rat mucin protein Muc2 (RMC), were transfected into COS cells and the resultant (35)S-labelled dimers and monomers were detected by SDS/PAGE of immunoprecipitates. The cystine-knot construct, encoding the C-terminal 115 amino acids, appeared in cell lysates as a 45 kDa dimer, but was not secreted. A construct, devoid of the cystine knot, failed to form dimers. Site-specific mutagenesis within the cystine knot was performed on a conserved unpaired cysteine (designated Cys-X), which has been implicated in some cystine-knot-containing growth factors as being important for intermolecular disulphide-bond formation. Dimerization of RMC was effectively abolished. Each cysteine (Cys-1-Cys-6) comprising the three intramolecular disulphide bonds of the cystine knot was then mutated. Dimer formation was impaired in each case, although much less so for the Cys-3 mutant than the others. Abnormal high-molecular-mass, disulphide-dependent aggregates formed with mutations Cys-1, Cys-2, Cys-4 and Cys-5(,) and were poorly secreted. It is concluded that the intact cystine-knot domain is essential for dimerization of the C-terminal domain of rat Muc2, and that residue Cys-X in the knot plays a key role. The structural integrity of the cystine knot, maintained by intramolecular bonds Cys-1-Cys-4, Cys-2-Cys-5 and Cys-3-Cys-6, also appears to be important for dimerization, probably by allowing correct positioning of the unpaired Cys-X residue for stable intermolecular cystine-bond formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,201

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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