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Enregistrement W1977359945 · doi:10.1073/pnas.1414555112

Human mutations in methylenetetrahydrofolate dehydrogenase 1 impair nuclear de novo thymidylate biosynthesis

2014· article· en· W1977359945 sur OpenAlexaff
Martha S. Field, Elena Kamynina, David Watkins, David S. Rosenblatt, Patrick J. Stover

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésThymidylate synthaseBiologyMegaloblastic anemiaMethylenetetrahydrofolate reductaseMethyltransferaseBiochemistryGeneticsMutationUracilBiosynthesisGenome instabilityMolecular biologyEnzymeGeneDNAMethylationAlleleDNA damageVitamin B12Cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An inborn error of metabolism associated with mutations in the human methylenetetrahydrofolate dehydrogenase 1 (MTHFD1) gene has been identified. The proband presented with SCID, megaloblastic anemia, and neurologic abnormalities, but the causal metabolic impairment is unknown. SCID has been associated with impaired purine nucleotide metabolism, whereas megaloblastic anemia has been associated with impaired de novo thymidylate (dTMP) biosynthesis. MTHFD1 functions to condense formate with tetrahydrofolate and serves as the primary entry point of single carbons into folate-dependent one-carbon metabolism in the cytosol. In this study, we examined the impact of MTHFD1 loss of function on folate-dependent purine, dTMP, and methionine biosynthesis in fibroblasts from the proband with MTHFD1 deficiency. The flux of formate incorporation into methionine and dTMP was decreased by 90% and 50%, respectively, whereas formate flux through de novo purine biosynthesis was unaffected. Patient fibroblasts exhibited enriched MTHFD1 in the nucleus, elevated uracil in DNA, lower rates of de novo dTMP synthesis, and increased salvage pathway dTMP biosynthesis relative to control fibroblasts. These results provide evidence that impaired nuclear de novo dTMP biosynthesis can lead to both megaloblastic anemia and SCID in MTHFD1 deficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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