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Enregistrement W1977373102 · doi:10.1186/1756-8935-6-s1-p121

A role for the histone chaperone DAXX in the structural organization of heterochromatin

2013· article· en· W1977373102 sur OpenAlexaff
Lindsy M Rapkin, Kashif Ahmed, Li Ren, David P. Bazett‐Jones

Notice bibliographique

RevueEpigenetics & Chromatin · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeterochromatinBiologyDeath-associated protein 6HistoneChaperone (clinical)Human geneticsGeneticsEvolutionary biologyHeterochromatin protein 1Cell biologyComputational biologyChromatinNuclear proteinDNATranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We show that H3K9me3-enriched heterochromatin domains (chromocentres) are disrupted in the absence of DAXX. Unlike chromocentres from wild type cells, which are radially symmetric, compact, and phosphorusrich, those from DAXX null cells are often irregularly shaped with altered phosphorus to nitrogen ratios and these abnormal chromocentres make unusual contacts with the surrounding chromatin. Immuno-FISH experiments demonstrated an aberrant spatial relationship between H3K9me3-enriched structures and major satellite DNA. Additionally, we show that the loss of DAXX results in disorganized nucleoli and ribosomal DNA (rDNA), and an increased number of cells containing mini nucleoli. Conclusions These findings demonstrate that loss of the histone chaperone DAXX results in the uncoupling of an epigenetic mark from the underlying chromatin structure and identifies a novel role of DAXX in the structural organization of heterochromatin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,618
Score d'incertitude au seuil0,488

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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