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Enregistrement W1977416705 · doi:10.1093/nar/gkt935

Nuclear ubiquitination by FBXL5 modulates Snail1 DNA binding and stability

2013· article· en· W1977416705 sur OpenAlexfundno aff
Rosa Viñas-Castells, Alex Frías, Estefanía Robles-Lanuza, Kezhong Zhang, Gregory D. Longmore, Antonio Garcı́a de Herreros, Víctor M. Diaz

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDavid Geffen School of Medicine, University of California, Los AngelesInstituto de Salud Carlos IIIUniversitat Pompeu FabraUniversity of TorontoYork UniversitySchool of Medicine, New York UniversityGeneralitat de CatalunyaUniversity of Texas Southwestern Medical Center
Mots-clésUbiquitin ligaseUbiquitinBiologyNuclear export signalCell biologyDownregulation and upregulationZinc fingerNuclear proteinF-box proteinMesenchymal stem cellCytoplasmTranscription factorMolecular biologyCell nucleusBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The zinc finger transcription factor Snail1 regulates epithelial to mesenchymal transition, repressing epithelial markers and activating mesenchymal genes. Snail1 is an extremely labile protein degraded by the cytoplasmic ubiquitin-ligases β-TrCP1/FBXW1 and Ppa/FBXL14. Using a short hairpin RNA screening, we have identified FBXL5 as a novel Snail1 ubiquitin ligase. FBXL5 is located in the nucleus where it interacts with Snail1 promoting its polyubiquitination and affecting Snail1 protein stability and function by impairing DNA binding. Snail1 downregulation by FBXL5 is prevented by Lats2, a protein kinase that phosphorylates Snail1 precluding its nuclear export but not its polyubiquitination. Actually, although polyubiquitination by FBXL5 takes place in the nucleus, Snail1 is degraded in the cytosol. Finally, FBXL5 is highly sensitive to stress conditions and is downregulated by iron depletion and γ-irradiation, explaining Snail1 stabilization in these conditions. These results characterize a novel nuclear ubiquitin ligase controlling Snail1 protein stability and provide the molecular basis for understanding how radiotherapy upregulates the epithelial to mesenchymal transition-inducer Snail1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,182
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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