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Enregistrement W1977416745 · doi:10.1074/jbc.m909289199

Multiple Roles for the Twin Arginine Leader Sequence of Dimethyl Sulfoxide Reductase of Escherichia coli

2000· article· en· W1977416745 sur OpenAlexaff
Sambasivarao Damaraju, Raymond J. Turner, Joanne L. Simala‐Grant, Gillian Shaw, Jing Hu, Joël H. Weiner

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryReductaseFumarate reductaseEscherichia coliMutantArginineChemistryFlavin groupBiologyEnzymeAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dimethyl sulfoxide (Me(2)SO) reductase of Escherichia coli is a terminal electron transport chain enzyme that is expressed under anaerobic growth conditions and is required for anaerobic growth with Me(2)SO as the terminal electron acceptor. The trimeric enzyme is composed of a membrane extrinsic catalytic dimer (DmsAB) and a membrane intrinsic anchor (DmsC). The amino terminus of DmsA has a leader sequence with a twin arginine motif that targets DmsAB to the membrane via a novel Sec-independent mechanism termed MTT for membrane targeting and translocation. We demonstrate that the Met-1 present upstream of the twin arginine motif serves as the correct translational start site. The leader is essential for the expression of DmsA, stability of the DmsAB dimer, and membrane targeting of the reductase holoenzyme. Mutation of arginine 17 to aspartate abolished membrane targeting. The reductase was labile in the leader sequence mutants. These mutants failed to support growth on glycerol-Me(2)SO minimal medium. Replacing the DmsA leader with the TorA leader of trimethylamine N-oxide reductase produced a membrane-bound DmsABC with greatly reduced enzyme activity and inefficient anaerobic respiration indicating that the twin arginine leaders may play specific roles in the assembly of redox enzymes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,349

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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