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Enregistrement W1977430176 · doi:10.2460/javma.244.3.352

Use of pooled protozoal cultures of preputial scraping samples obtained from bulls for the detection of Tritrichomonas foetus by means of a real-time polymerase chain reaction assay

2014· article· en· W1977430176 sur OpenAlexaff
A. García-Guerra, Janet E. Hill, John Campbell, Cheryl Waldner, Steven Hendrick

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Veterinary Medical Association · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPreputial glandTritrichomonas foetusBiologyReal-time polymerase chain reactionFetusPolymerase chain reactionMolecular biologyAndrologyMedicinePregnancyEndocrinologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To determine the sensitivity of a real-time PCR assay for the detection of Tritrichomonas foetus in protozoal cultures of preputial scraping samples pooled from up to 25 bulls and to determine the specificity of that assay for detection of T foetus in cultures for individual animals. DESIGN: Cross-sectional study. ANIMALS: 188 bulls and 150 steers. PROCEDURES: Preputial scraping samples were collected, placed in a culture kit, and incubated at 37°C for 7 days. Cultures for individual animals were tested for T foetus by means of a real-time PCR assay. Pools of protozoal cultures were made by including fixed aliquots of samples with known positive and negative results in ratios of 1:2, 1:3, 1:5, 1:10, 1:15, 1:20, and 1:25. Specificities of the real-time PCR assay and culture for detection of T foetus in samples obtained from individual animals and sensitivity of real-time PCR assay for each evaluated pool ratio were determined. RESULTS: Specificity estimates for culture and the real-time PCR assay for detection of T foetus in preputial scraping samples for individual animals were not significantly different (98.8% and 100%, respectively). Sensitivities of the real-time PCR assay for the various pooled samples with known positive and negative T foetus results were not significantly different; overall sensitivity of the assay was 94%. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: Results indicated the evaluated real-time PCR assay had high specificity and good sensitivity for the detection of T foetus in pooled protozoal cultures of preputial scraping samples obtained from up to 25 animals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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