Novel NADPH-dependent L-aspartate dehydrogenases from the mesophilic nitrogen-fixing bacteria Rhodopseudomonas palustris and Bradyrhizobium japonicum
Notice bibliographique
Résumé
The genes encoding putative L-aspartate dehydrogenases (EC 1.4.1.21, ADH) from the mesophilic nitrogen-fixing bacteria Rhodopseudomonas palustris and Bradyrhizobium japonicum were cloned and expressed in Escherichia coli. The respective enzymes in the form of hybrid proteins with N-terminal hexahistidine tags were purified to apparent homogeneity. Both enzymes catalyzed in vitro the reductive amination of oxaloacetate to L-aspartate by an order faster than the reverse reaction at a respective pH optimum of 8.0-9.0 and 9.8; also, the enzymes only catalyzed amination under physiological conditions (pH 7.0-8.0). Their specificity to NADPH was higher by 1-2 orders of magnitude than that to NADH. The apparent KM values of ADHs from R. palustris for oxaloacetate, ammonium, and NADPH at pH 9.0 were 9.2, 11.3, and 0.21 mM, respectively, and the corresponding KM values of ADH from B. japonicum were 21, 4.3, and 0.032 mM, respectively. The amination activity of novel ADHs may be important for the fixation of inorganic nitrogen in vivo and used for the construction of a bacterial strain-producer of L-aspartate by metabolic engineering methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».