Identification, expression and interaction analyses of calcium-dependent protein kinase (CPK) genes in canola (Brassica napusL.)
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Canola (Brassica napus L.) is one of the most important oil-producing crops in China and worldwide. The yield and quality of canola is frequently threatened by environmental stresses including drought, cold and high salinity. Calcium is a well-known ubiquitous intracellular secondary messenger in plants. Calcium-dependent protein kinases (CPKs) are Ser/Thr protein kinases found only in plants and some protozoans. CPKs are Ca2+ sensors that have both Ca2+ sensing function and kinase activity within a single protein and play crucial roles in plant development and responses to various environmental stresses. RESULTS: In this study, we mined the available expressed sequence tags (ESTs) of B. napus and identified a total of 25 CPK genes, among which cDNA sequences of 23 genes were successfully cloned from a double haploid cultivar of canola. Phylogenetic analysis demonstrated that they could be clustered into four subgroups. The subcellular localization of five selected BnaCPKs was determined using green fluorescence protein (GFP) as the reporter. Furthermore, the expression levels of 21 BnaCPK genes in response to salt, drought, cold, heat, abscisic acid (ABA), low potassium (LK) and oxidative stress were studied by quantitative RT-PCR and were found to respond to multiple stimuli, suggesting that canola CPKs may be convergence points of different signaling pathways. We also identified and cloned five and eight Clade A basic leucine zipper (bZIP) and protein phosphatase type 2C (PP2C) genes from canola and, using yeast two-hybrid and bimolecular fluorescence complementation (BiFC), determined the interaction between individual BnaCPKs and BnabZIPs or BnaPP2Cs (Clade A). We identified novel, interesting interaction partners for some of the BnaCPK proteins. CONCLUSION: We present the sequences and characterization of CPK gene family members in canola for the first time. This work provides a foundation for further crop improvement and improved understanding of signal transduction in plants.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».