Abstract ES2-3: The Clonal and Mutational Composition of Triple Negative Breast Cancers
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The notion that cancers are mosaics, composed of clones of cells has been fundamental to cancer biology for several decades. Clonal evolution may underpin clinical features of cancer, such as emergence of treatment resistance, the heterogeneous responses of metastatic disease within individual patients and divergence between primary and metastatic disease. Spatial and temporal variation in clonal composition poses significant challenges for diagnostic sampling and disease monitoring. We have recently developed next generation sequencing approaches to these questions and applied them to the understanding of mutational and clonal composition of primary triple negative breast cancers (TNBC). The notion that triple negative breast cancers form a distinct disease entity is already strongly challenged by expression analysis and small scale mutational analysis. Our results show that both the mutational composition and clonal structure of primary triple negative breast cancers is in fact a complete spectrum, exploding the notion of TNBC (currently defined), as a distinct disease. Clonal analysis suggests a means by which the genetic complexity might be reduced by following patient evolution over time and space. I will discuss the specific implications of the mutational and transcriptome landscapes of TNBC in relation to possible disease biologies. Citation Information: Cancer Res 2012;72(24 Suppl):Abstract nr ES2-3.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».