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Enregistrement W1977704476 · doi:10.1897/03-633

Feminization of female leukophore-free strain of Japanese medaka (<i>Oryzias latipes</i>) exposed to 17β-estradiol

2004· article· en· W1977704476 sur OpenAlexaff
Gordon C. Balch, Karmi Shami, Paul J. Wilson, Yuko Wakamatsu, Chris D. Metcalfe

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReproductive biology and impacts on aquatic species
Établissements canadiensTrent University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOryziasBiologyGenotypeFeminization (sociology)GeneticsPhenotypeEstrogenAndrologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The recently developed female leukophore-free (FLFII) strain of Japanese medaka (Oryzias latipes) carries DNA markers for the identification of genotypic sex. Information regarding genotypic sex is useful for tests in which endocrine-disrupting compounds may masculinize or feminize fish. In the present study, methods were developed to automate DNA extraction and profiling for rapid determination of genotypic sex. Adequate amounts of DNA were isolated by robotic extraction procedures from the caudal fin. New primers were developed to include an 18-base pair segment that is in the X chromosome of female medaka but is absent in the Y chromosome of male medaka. Automated profiling methods with 96-well plates permitted analysis of the genomic sex of medaka at rates of up to 500 fish/d. We investigated the sensitivity of the FLFII strain to the feminizing effects of the potent estrogen 17beta-estradiol (E2), and we compared this sensitivity to that of a wild strain that has been used widely in the study of endocrine-disrupting compounds. All FLFII medaka exposed to 1 microg/L of E2 (n = 50) had the female gonadal phenotype (i.e., ovaries), and all but one wild-strain medaka exposed to 1 microg/L of E2 (i.e., 47 of 48 fish) had the female gonadal phenotype, indicating that the FLFII and wild strains have approximately equal sensitivities to the feminizing effects of E2. Analysis of the genotype of FLFII medaka confirmed that 100% of fish with the male genotype had been feminized to the female gonadal phenotype. The FLFII strain is an excellent teleost model for detecting feminization or masculinization of fish, and automated methods can be used for rapid analysis of the genotypic sex of FLFII medaka.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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