Multiple Variants in Vascular Endothelial Growth Factor (VEGFA) Are Risk Factors for Time to Severe Retinopathy in Type 1 Diabetes
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: We sought to determine if any common variants in the gene for vascular endothelial growth factor (VEGFA) are associated with long-term renal and retinal complications in type 1 diabetes. RESEARCH DESIGN AND METHODS: A total of 1,369 Caucasian subjects with type 1 diabetes from the Diabetes Control and Complications Trial (DCCT)/Epidemiology of Diabetes Interventions and Complications (EDIC) Study had an average of 17 retinal photographs and 10 renal measures over 15 years. In the DCCT/EDIC, we studied 18 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in VEGFA that represent all linkage disequilibrium bins (pairwise r(2) > or = 0.64) and tested them for association with time to development of severe retinopathy, three or more step progression of retinopathy, clinically significant macular edema, persistent microalbuminuria, and severe nephropathy. RESULTS: In a global multi-SNP test, there was a highly significant association of VEGFA SNPs with severe retinopathy (P = 6.8 x 10(-5))-the four other outcomes were all nonsignificant. In survival analyses controlling for covariate risk factors, eight SNPs showed significant association with severe retinopathy (P < 0.05). The most significant single SNP association was rs3025021 (hazard ratio 1.37 [95% CI 1.13-1.66], P = 0.0017). Family-based analyses of severe retinopathy provide evidence of excess transmission of C at rs699947 (P = 0.029), T at rs3025021 (P = 0.013), and the C-T haplotype from both SNPs (P = 0.035). Multi-SNP regression analysis including 15 SNPs, and allowing for pairwise interactions, independently selected 6 significant SNPs (P < 0.05). CONCLUSIONS: These data demonstrate that multiple VEGFA variants are associated with the development of severe retinopathy in type 1 diabetes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».