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Enregistrement W1977772750 · doi:10.2337/db07-0376

Multiple Variants in Vascular Endothelial Growth Factor (VEGFA) Are Risk Factors for Time to Severe Retinopathy in Type 1 Diabetes

2007· article· en· W1977772750 sur OpenAlexafffund
Hussam Al‐Kateb, Lucia Mirea, Xinlei Xie, Lei Sun, Xiaoqing Liu, Hongtao Chen, Shelley B. Bull, Andrew P. Boright, Andrew D. Paterson

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversity Health NetworkLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchGeorge Washington UniversityAmerican Diabetes Association
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismDiabetic retinopathyMedicineRetinopathyType 1 diabetesInternal medicineDiabetes mellitusHazard ratioHaplotypeSNPEndocrinologyBiologyAlleleGeneticsGenotypeConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: We sought to determine if any common variants in the gene for vascular endothelial growth factor (VEGFA) are associated with long-term renal and retinal complications in type 1 diabetes. RESEARCH DESIGN AND METHODS: A total of 1,369 Caucasian subjects with type 1 diabetes from the Diabetes Control and Complications Trial (DCCT)/Epidemiology of Diabetes Interventions and Complications (EDIC) Study had an average of 17 retinal photographs and 10 renal measures over 15 years. In the DCCT/EDIC, we studied 18 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in VEGFA that represent all linkage disequilibrium bins (pairwise r(2) > or = 0.64) and tested them for association with time to development of severe retinopathy, three or more step progression of retinopathy, clinically significant macular edema, persistent microalbuminuria, and severe nephropathy. RESULTS: In a global multi-SNP test, there was a highly significant association of VEGFA SNPs with severe retinopathy (P = 6.8 x 10(-5))-the four other outcomes were all nonsignificant. In survival analyses controlling for covariate risk factors, eight SNPs showed significant association with severe retinopathy (P < 0.05). The most significant single SNP association was rs3025021 (hazard ratio 1.37 [95% CI 1.13-1.66], P = 0.0017). Family-based analyses of severe retinopathy provide evidence of excess transmission of C at rs699947 (P = 0.029), T at rs3025021 (P = 0.013), and the C-T haplotype from both SNPs (P = 0.035). Multi-SNP regression analysis including 15 SNPs, and allowing for pairwise interactions, independently selected 6 significant SNPs (P < 0.05). CONCLUSIONS: These data demonstrate that multiple VEGFA variants are associated with the development of severe retinopathy in type 1 diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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