Effect of Temperature on the Structure of Trout Troponin C
Notice bibliographique
Résumé
Adaptation for life at different temperatures can cause changes in many aspects of an organism. One example is the expression of different protein isoforms in species adapted to different temperatures. The calcium regulatory protein cardiac troponin C (cTnC), from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), is a good model for studying temperature effects, both because of its low physiological temperature and because mammalian cTnC, extensively studied at higher temperatures, can be used for comparison. We determined the structure and studied the backbone dynamics of the regulatory domain of trout cardiac troponin C (ScNTnC) with one Ca(2+) bound at 7 and 30 degrees C, using nuclear magnetic resonance spectroscopy (NMR). The overall fold of the regulatory domain of trout cTnC at both temperatures is similar to the regulatory domain of mammalian (human, bovine, and porcine isoform) cTnC bound to one Ca(2+). By comparing the trout structures at the two temperatures, we identify differences between the positions of the helices flanking the calcium binding loops, and the overall structure at 7 degrees C is more compact than that at 30 degrees C. The structure at 7 degrees C is more similar to the mammalian cTnC, which was determined at 30 degrees C, indicating that they have the same conformation at their respective physiological temperatures. The dynamic properties of the regulatory domain of trout cTnC are similar at the two temperatures that were used in these studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».