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Enregistrement W1977780649 · doi:10.1021/bi035504z

Effect of Temperature on the Structure of Trout Troponin C

2004· article· en· W1977780649 sur OpenAlexafffund
Tharin M. A. Blumenschein, Todd E. Gillis, Glen F. Tibbits, Brian D. Sykes

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensWomen and Children’s Health Research InstituteSimon Fraser UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRainbow troutTroutTroponin CGene isoformBiophysicsTroponinChemistryCrystallographyFish <Actinopterygii>BiochemistryBiologyGeneFisheryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adaptation for life at different temperatures can cause changes in many aspects of an organism. One example is the expression of different protein isoforms in species adapted to different temperatures. The calcium regulatory protein cardiac troponin C (cTnC), from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), is a good model for studying temperature effects, both because of its low physiological temperature and because mammalian cTnC, extensively studied at higher temperatures, can be used for comparison. We determined the structure and studied the backbone dynamics of the regulatory domain of trout cardiac troponin C (ScNTnC) with one Ca(2+) bound at 7 and 30 degrees C, using nuclear magnetic resonance spectroscopy (NMR). The overall fold of the regulatory domain of trout cTnC at both temperatures is similar to the regulatory domain of mammalian (human, bovine, and porcine isoform) cTnC bound to one Ca(2+). By comparing the trout structures at the two temperatures, we identify differences between the positions of the helices flanking the calcium binding loops, and the overall structure at 7 degrees C is more compact than that at 30 degrees C. The structure at 7 degrees C is more similar to the mammalian cTnC, which was determined at 30 degrees C, indicating that they have the same conformation at their respective physiological temperatures. The dynamic properties of the regulatory domain of trout cTnC are similar at the two temperatures that were used in these studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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