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Enregistrement W1977885289 · doi:10.1371/journal.pone.0037221

Conserved Orb6 Phosphorylation Sites Are Essential for Polarized Cell Growth in Schizosaccharomyces pombe

2012· article· en· W1977885289 sur OpenAlexafffund
Guohong Liu, Dallan Young

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAutophosphorylationPhosphorylationCell biologyKinaseBiologySubstrate-level phosphorylationSchizosaccharomyces pombeProtein kinase ABiochemistryMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Ndr-related Orb6 kinase is a key regulator of polarized cell growth in fission yeast, however the mechanism of Orb6 activation is unclear. Activation of other Ndr kinases involves both autophosphorylation and phosphorylation by an upstream kinase. Previous reports suggest that the Nak1 kinase functions upstream from Orb6. Supporting this model, we show that HA-Orb6 overexpression partially restored cell polarity in nak1 ts cells. We also demonstrated by coimmunoprecipitation and in vitro binding assays that Nak1 and Orb6 physically interact, and that the Nak1 C-terminal region is required for Nak1/Orb6 complex formation in vivo. However, results from in vitro kinase assays did not show phosphorylation of recombinant Orb6 by HA-Nak1, suggesting that Orb6 activation may not involve direct phosphorylation by Nak1. To investigate the role of Orb6 phosphorylation and activity, we substituted Ala at the ATP-binding and conserved phosphorylation sites. Overexpression of kinase-dead HA-Orb6(K122A) in wild-type cells resulted in a loss of cell polarity, suggesting that it has a dominant-negative effect, and it failed to rescue the polarity defect of nak1 or orb6 ts mutants. Recombinant GST-Orb6(S291A) did not autophosphorylate in vitro suggesting that Ser291 is the primary autophosphorylation site. HA-Orb6(S291A) overexpression only partially rescued the orb6 polarity defect and failed to rescue the nak1 defect, suggesting that autophosphorylation is important for Orb6 function. GST-Orb6(T456A) autophosphorylated in vitro, indicating that the conserved phosphorylation site at Thr456 is not essential for kinase activity. However, HA-Orb6(T456A) overexpression had similar effects as overexpressing kinase-dead HA-Orb6(K122A), suggesting that Thr456 is essential for Orb6 function in vivo. Also, we found that both phosphorylation site mutations impaired the ability of Myc-Nak1 to coimmunoprecipitate with HA-Orb6. Together, our results suggest a model whereby autophosphorylation of Ser291 and phosphorylation of Thr456 by an upstream kinase promote Nak1/Orb6 complex formation and Orb6 activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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