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Enregistrement W1977902287 · doi:10.1002/cjoc.200890038

TDDFT Study of the Electronic Structure, Absorption and Emission Spectra of the Light Emitters of the Amazing Firefly Bioluminescence and Solvation Effects on the Spectra

2008· article· en· W1977902287 sur OpenAlexaff
Ai‐Min Ren, Jing‐Fu Guo, Ji‐Kang Feng, Luyi Zou, Zhongwei Li, John D. Goddard

Notice bibliographique

RevueChinese Journal of Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTime-dependent density functional theoryChemistrySolvationLuciferinExcited stateDensity functional theoryEmission spectrumAbsorption spectroscopySpectral linePhotochemistryComputational chemistryMoleculeAtomic physicsOrganic chemistryOpticsLuciferasePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The ground and excited state properties of luciferin (LH2) and oxyluciferin (OxyLH2), the bioluminescent chemicals in the firefly, have been characterized using density functional theory (DFT) and time dependent DFT (TDDFT) methods. The effects of solvation on the electronic absorption and emission spectra of luciferin and oxyluciferin were predicted with a self‐consistent isodensity polarized continuum model of the solvent using TDDFT. The S0→S1 vertical excitation energies in the gas phase and in water were obtained. Optimizations of the excited state geometries permitted the first predictions of the fluorescence spectra for these biologically important molecules. Shifts in both of the absorption and emission spectra on proceeding from the gas phase to aqueous solution were also predicted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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