Theoretical analysis on changes in thermodynamic quantities upon protein folding: Essential role of hydration
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The free energy change associated with the coil-to-native structural transition of protein G in aqueous solution is calculated by using the molecular theory of solvation, also known as the three-dimensional reference interaction site model theory, to uncover the molecular mechanism of protein folding. The free energy is decomposed into the protein intramolecular energy, the hydration energy, and the hydration entropy. The folding is accompanied with a large gain in the protein intramolecular energy. However, it is almost canceled by the correspondingly large loss in the hydration energy due to the dehydration, resulting in the total energy gain about an order of magnitude smaller than might occur in vacuum. The hydration entropy gain is found to be a substantial driving force in protein folding. It is comparable with or even larger than the total energy gain. The total energy gain coupled with the hydration entropy gain is capable of suppressing the conformational entropy loss in the folding. Based on careful analysis of the theoretical results, the authors present a challenging physical picture of protein folding where the overall folding process is driven by the water entropy effect.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle