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Enregistrement W1977964445 · doi:10.1111/j.1742-4658.2005.04920.x

RETRACTED: Characterization of novel sequence motifs within N‐ and C‐terminal extensions of p26, a small heat shock protein from <i>Artemia franciscana</i>

2005· article· en· W1977964445 sur OpenAlexaff
Yu Sun, Thomas H. MacRae

Dossier post-publication

OpenAlex signale ce travail comme rétracté, mais aucune notice correspondante de Retraction Watch ne figure dans cette base.

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryBiologyPeptide sequenceHeat shock proteinChaperone (clinical)SerineMolecular biologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The small heat shock proteins function as molecular chaperones, an activity often requiring reversible oligomerization and which protects against irreversible protein denaturation. An abundantly produced small heat shock protein termed p26 is thought to contribute to the remarkable stress resistance exhibited by encysted embryos of the crustacean, Artemia franciscana. Three novel sequence motifs termed G, R and TS were individually deleted from p26 by site-directed mutagenesis. G encompasses residues G8-G29, a glycine-enriched region, and R includes residues R36-R45, an arginine-enhanced sequence, both in the amino terminus. TS, composed of residues T169-T186, resides in the carboxy-extension and is augmented in threonine and serine. Deletion of R had more influence than removal of G on p26 oligomerization and chaperoning, the latter determined by thermotolerance induction in Escherichia coli, protection of insulin and citrate synthase from dithiothreitol- and heat-induced aggregation, respectively, and preservation of citrate synthase activity upon heating. Oligomerization of the TS and R variants was similar, but the TS deletion was slightly more effective than R as a chaperone. The extent of p26 structural perturbation introduced by internal deletions, including modification of intrinsic fluorescence, 1-anilino-8-naphthalene-sulphonate binding and secondary structure, paralleled reductions in oligomerization and chaperoning. Three-dimensional modeling of p26 based on wheat Hsp16.9 crystal structure indicated many similarities between the two proteins, including peptide loops associated with secondary structure elements. Loop 1 of p26 was deleted in the G variant with minimal effect on oligomerization and chaperoning, whereas loop 3, containing beta-strand 6 was smaller than the corresponding loop in Hsp16.9, which may influence p26 function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,999
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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