Biology and Genome Sequence of Streptococcus mutans Phage M102AD
Notice bibliographique
Résumé
M102AD is the new designation for a Streptococcus mutans phage described in 1993 as phage M102. This change was necessitated by the genome analysis of another S. mutans phage named M102, which revealed differences from the genome sequence reported here. Additional host range analyses confirmed that S. mutans phage M102AD infects only a few serotype c strains. Phage M102AD adsorbed very slowly to its host, and it cannot adsorb to serotype e and f strains of S. mutans. M102AD adsorption was blocked by c-specific antiserum. Phage M102AD also adsorbed equally well to heat-treated and trypsin-treated cells, suggesting carbohydrate receptors. Saliva and polysaccharide production did not inhibit plaque formation. The genome of this siphophage consisted of a linear, double-stranded, 30,664-bp DNA molecule, with a GC content of 39.6%. Analysis of the genome extremities indicated the presence of a 3'-overhang cos site that was 11 nucleotides long. Bioinformatic analyses identified 40 open reading frames, all in the same orientation. No lysogeny-related genes were found, indicating that phage M102AD is strictly virulent. No obvious virulence factor gene candidates were found. Twelve proteins were identified in the virion structure by mass spectrometry. Comparative genomic analysis revealed a close relationship between S. mutans phages M102AD and M102 as well as with Streptococcus thermophilus phages. This study also highlights the importance of conducting research with biological materials obtained from recognized microbial collections.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».