Genomic Organization of the Human and Mouse <i>stau</i> Genes
Notice bibliographique
Résumé
Mammalian Staufen is a double-stranded RNA-binding protein potentially involved in mRNA transport and localization. Recently, we reported that the human gene is located on chromosome 20, region q13.1. We now report the genomic organization of both the human and mouse stau genes. Amplification of genomic DNA and sequencing of the resulting PCR products indicated that the human and mouse genes are fragmented into 15 and 12 exons, distributed over at least 65 and 17 kb of genomic DNA, respectively. The three additional exons found in the human gene are subjected to differential splicing, generating four different transcripts. Corresponding exons have not been found in mouse transcripts. Apart from those three exons, the overall organization of the stau gene is similar in the two species, and the positions of the exon-intron junctions are perfectly conserved. Even an alternative choice between two splicing acceptor sites, which causes an insertion of 18 nucleotides in exon 5, is conserved in both humans and mice. An extremely G+C-rich region lacking canonical TATA and CAAT boxes was found upstream of the most 5' RACE sequence, suggesting that a housekeeping-like promoter drives the broad expression of Staufen in mammalian cells. This work represents the first step toward production of knockout mice and the elucidation of putative Staufen-linked hereditary diseases in humans.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».