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Enregistrement W1977997233 · doi:10.1074/jbc.m300925200

Processing of Macromolecular Heparin by Heparanase

2003· article· en· W1977997233 sur OpenAlexaff
Per Jemth, Martha L. Escobar Galvis, Israël Vlodavsky, Alan Horner, Ulf Lindahl, Jin‐Ping Li

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeparanaseHeparinHeparan sulfateProteoglycanAntithrombinBiochemistryChemistrySulfationExtracellularExtracellular matrixMolecular biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heparanase is an endo-glucuronidase expressed in a variety of tissues and cells that selectively cleaves extracellular and cell-surface heparan sulfate. Here we propose that this enzyme is involved also in the processing of serglycin heparin proteoglycan in mouse mast cells. In this process, newly synthesized heparin chains (60-100 kDa) are degraded to fragments (10-20 kDa) similar in size to commercially available heparin (Jacobsson, K. G., and Lindahl, U. (1987) Biochem. J. 246, 409-415). A fraction of these fragments contains the specific pentasaccharide sequence required for high affinity binding to antithrombin implicated with anticoagulant activity. Rat skin heparin, which escapes processing in vivo, was used as a substrate in reaction with recombinant human heparanase. An incubation product of commercial heparin size retained the specific pentasaccharide sequence, although oligosaccharides (3-4 kDa) containing this sequence could be degraded by the same enzyme. Commercial heparin was found to be a powerful inhibitor (I50 approximately 20 nM expressed as disaccharide unit, approximately 0.7 nM polysaccharide) of heparanase action toward antithrombin-binding oligosaccharides. Cells derived from a serglycin-processing mouse mastocytoma expressed a protein highly similar to other mammalian heparanases. These findings strongly suggest that the intracellular processing of the heparin proteoglycan polysaccharide chains is catalyzed by heparanase, which primarily cleaves target structures distinct from the antithrombin-binding sequence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,452

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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