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Enregistrement W1978000105 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-200

Abstract 200: Identification of proteins involved in c-Myc induced mammary epithelia apoptosis in 3D culture system

2011· article· en· W1978000105 sur OpenAlexaff
Ling Huang, Elizabeth Tai, Senthil K. Muthuswamy

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Research and Treatments
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApoptosisMammary tumorCarcinogenesisCell biologyCell cultureBiologyMorphogenesisCancer researchSmall hairpin RNACell growthCancerGene knockdownGeneBreast cancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Identification of proteins involved in c-Myc induced mammary epithelia apoptosis in 3D culture system We have previously discovered that depletion of a cell polarity gene Scribble in mammary epithelial cells disrupted cell polarity, apoptosis and morphogenesis in three dimensional cell culture as well as inducing dysplasia that progressed into tumor in mice. Loss of Scribble also inhibited c-Myc induced apoptosis to cause cell transformation in vitro and tumor formation in vivo. Scribble mutant with deficiency in membrane localization resulted in similar phenotypes. These results suggest that Scribble is a tumor suppressor in mammary gland epithelial cells and its functions depends on correct cellular localization. Furthermore, Scribble is required to inhibit Myc-induced tumorigenesis by blocking Myc-induced apoptosis. I am interested in identifying proteins that are involved in Scribble dependent apoptosis as well as discovering other polarity proteins that cooperate with c-Myc for mammary tumor progression. To address the two questions, I use MCF10A three dimensional culture system and RNAi technology to screen proteins participating in apoptosis during c-Myc induced mammary epithelial cell transformation. We will report a screen to identify proteins that are involved in c-Myc induced mammary epithelial cell apoptosis in 3D culture, using a lentiviral shRNA library. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 200. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-200

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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Résumé présentoui

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