Abstract 200: Identification of proteins involved in c-Myc induced mammary epithelia apoptosis in 3D culture system
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Identification of proteins involved in c-Myc induced mammary epithelia apoptosis in 3D culture system We have previously discovered that depletion of a cell polarity gene Scribble in mammary epithelial cells disrupted cell polarity, apoptosis and morphogenesis in three dimensional cell culture as well as inducing dysplasia that progressed into tumor in mice. Loss of Scribble also inhibited c-Myc induced apoptosis to cause cell transformation in vitro and tumor formation in vivo. Scribble mutant with deficiency in membrane localization resulted in similar phenotypes. These results suggest that Scribble is a tumor suppressor in mammary gland epithelial cells and its functions depends on correct cellular localization. Furthermore, Scribble is required to inhibit Myc-induced tumorigenesis by blocking Myc-induced apoptosis. I am interested in identifying proteins that are involved in Scribble dependent apoptosis as well as discovering other polarity proteins that cooperate with c-Myc for mammary tumor progression. To address the two questions, I use MCF10A three dimensional culture system and RNAi technology to screen proteins participating in apoptosis during c-Myc induced mammary epithelial cell transformation. We will report a screen to identify proteins that are involved in c-Myc induced mammary epithelial cell apoptosis in 3D culture, using a lentiviral shRNA library. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 200. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-200
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».