Proteome analysis of embryo and endosperm from germinating tomato seeds
Notice bibliographique
Résumé
Proteome analysis of embryo and endosperm tissues from germinating tomato seed was conducted using 1-DE, 2-DE, and MS. Mobilization of the most abundant proteins, which showed similar profiles in the two tissues, occurred first in the endosperm. CBB R-250 staining of 2-DE gels revealed 352 and 369 major protein spots in the embryo and endosperm, respectively, at 0 h. Of these, 75 major spots were selected, excised, in-gel digested with trypsin, and analyzed by MALDI-TOF-MS and/or LC-ESI-Q/TOF-MS/MS. Peptide MS and MS/MS data were searched against publicly available protein and EST databases, and 47 proteins identified. Embryo-specific proteins included a BAC19.13 homologue, whereas four proteins specific to the endosperm were tomato mosaic virus coat proteins related to defense mechanisms. The most abundant proteins both in the embryo and endosperm were seed storage proteins, i.e., legumins (11 spots), vicilins (11 spots), albumin (2 spots). Housekeeping enzymes, actin-binding profilin, defense-related protein kinases, nonspecific lipid transfer protein, and proteins involved in general metabolism were also identified. The roles of some of the proteins identified in the embryo and endosperm are discussed in relation to seed germination in tomato.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».